旧はてなダイアリーで書いた記事は自動で移行できますが、アドセンスの設定は再度実施しなければ行けません。手順を以下に記載します。
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1.google adsenseで新しい広告ユニットを設定する
既に過去にgoogle adsenseのアカウントを持っており、審査が通っている場合は「新しい広告ユニットを作成」するだけで、新しいはてなブログ用の広告ユニットを作成できます。アカウント1つで複数のサイト向けの広告ユニットを作成できます。
※参考https://support.google.com/adsense/answer/65063?ctx=as2&rd=1
2.管理画面から広告ユニットのタグを貼付ける
フッタ、ヘッダ、サイドバーには管理画面から広告の設定を行う事ができます。
「管理画面→デザイン→カスタマイズ」でそれぞれ設定が可能です。
フッタについてはスマートフォン版にも表示するのチェックボックスがあります。
なお、記事中への表示は管理画面からは行えません。
なお、タグを貼付けてから数分で広告が表示されるようになりました。
3.デフォルトで表示されているはてなのアドセンス広告を外す(はてなブログproのみ)
はてなブログには何もしなくてもアドセンス広告が表示されていますが、これははてな運営のアカウントのアドセンスです。それとは別に上記で行った自分のアドセンス広告が表示さています。
デフォルトで表示されるAdSenseと、ユーザーさまが設置されたAdSenseと、ともに作用します
http://staff.hatenablog.com/entry/2012/10/31/171248
公式ブログにある通り、はてなのアドセンスと自分のアドセンスが両方ある場合、
自分のアドセンスがクリックされる確率が下がってしまいますので、はてなブログproに申し込んでいる場合はデフォルトのはてなのアドセンスは消しましょう。
「管理画面→設定→詳細設定」から消す事が出来ます。